Lincoln Burrows wird von einem amerikanischen Gericht zum Tode verurteilt, da er den Bruder der amerikanischen Vizepräsidentin ermordet haben soll. Bis zur Vollstreckung wird er in das Fox River State Penitentiary gebracht. Sein Bruder Michael glaubt jedoch nicht an Lincolns Schuld, und so trifft es sich gut, dass dieser als Statiker beim Umbau des Gefängnisses dabei war. Michael fasst einen kühnen Plan: Er sorgt dafür, dass er selber im Fox River State landet, um bei einem riskanten Ausbruch seinen Bruder zu befreien. Er weiß, dass er auf Hilfe von Innen angewiesen ist, und es bleibt ihm nichts anderes übrig, als sich im Gefängnis Verbündete zu suchen.
